Izotermalna amplifikacija posredovana petljom (lamP) kao metoda za terensku detekciju SarS-cov- virusa
loop-mediated isothermal amplification (lamP) as a point-of-care SarS-covdetection method
Аутори
Djisalov, MilaKnežić, Teodora
Janjušević, Ljiljana
Popović, Željko
Kosijer, Petar
Gadjanski, Ivana
Остала ауторства
Pavlović, SonjaBegović, Jelena
Novaković, Ivana
Savić Pavićević, Dušanka
Đorđević, Ana
Поглавље у монографији (Објављена верзија)
Метаподаци
Приказ свих података о документуАпстракт
Pravovremeno testiranje većeg broja ljudi na SARS-CoV-2 virus je povezano sa nižim mortalitetom od
COVID-19 oboljenja. Međutim, većina zemalja nema mogućnosti za takvo masivno testiranje putem metode
“PCR u realnom vremenu”, zbog visoke cene neophodne opreme i potrebe za stručnim osobljem.
Zbog toga se razvijaju brze i ekonomičnije metode, koje se najčešće zasnivaju na izotermalnim metodama
amplifikacije DNK. Za ove metode nije potreban ciklični termostat, zbog čega su primenljivije za
terensku upotrebu. Fokus je na izotermalnoj amplifikaciji posredovanoj petljom (lamP), zbog njene
visoke specifičnosti, mogućnosti za upotrebu neprečišćenih uzoraka i jednostavnosti merenja signala. Autori
predstavljaju pregled najvažnijih radova o LAMP metodi za detekciju SARS-CoV-2 virusa objavljenih
tokom 2020. godine, kao i opise nekoliko komercijalnih kompleta na bazi LAMP metode za COVID-19 testiranje.
Massive testing for SARS-CoV-2 virus is related to lower mortality rates of COVID-19. Most countries face
challenges to perform massive testing with the currently available methods (real-time PCR), due to expensive
equipment and requirement of highly skilled personnel. To overcome these challenges, faster
and cost-effective alternative detection methods are being developed, primarily based on isothermal
methods of nucleic acid amplification (isoNAAs). PCR depends on precision instruments, high cleanliness
of operating conditions and cannot be easily used on-site, while isoNAAs, which do not require
thermal cyclers, are more applicable for point-of-care (PoC) use. Loop-mediated isothermal amplification
(LAMP) is one of the isoNAA most in focus for COVID-19 tests due to its high specificity and possibility to
use unpurified specimens in combination with simplified detection setup. The article gives a review of
the most significant publications on use of LAMP for SARS-CoV-2 detec...tion and of the several commercial
LAMP-based COVID-19 testing kits.
Кључне речи:
izotermalna amplifikacija / LAMP / terenska detekcija / SARS-CoV-2 / COVID-19 / isothermal amplification / LAMP / point-of-care detection / SARS-CoV-2 / COVID-19Извор:
Trendovi u molekularnoj Biologiji, 2021, 1, 21-32Издавач:
- Beograd : Institut za molekularnu genetiku i genetičko inženjerstvo
Финансирање / пројекти:
- Horizont 2020 Evropske unije sa brojevima ugovora 739570 (ANTARES) i 872662 (IPANEMA)
- Министарство науке, технолошког развоја и иновација Републике Србије, институционално финансирање - 200358 (BioSense институт) (RS-MESTD-inst-2020-200358)
- Министарство науке, технолошког развоја и иновација Републике Србије, институционално финансирање - 200125 (Универзитет у Новом Саду, Природно-математички факултет) (RS-MESTD-inst-2020-200125)
Напомена:
- Ministarstva prosvete, nauke i tehnološkog razvoja Republike Srbije – broj ugovora 451-03-68/2020-14/ 200358 za autore M. Dj, T.K i Lj.J i broj ugovora 451-03-9/2021- 14/200125 za Ž.D.P. Autori zahvaljuju Jeleni Ognjenov na pomoći u pripremi ilustracija za rad.
Институција/група
Institut za molekularnu genetiku i genetičko inženjerstvoTY - CHAP AU - Djisalov, Mila AU - Knežić, Teodora AU - Janjušević, Ljiljana AU - Popović, Željko AU - Kosijer, Petar AU - Gadjanski, Ivana PY - 2021 UR - https://imagine.imgge.bg.ac.rs/handle/123456789/1724 AB - Pravovremeno testiranje većeg broja ljudi na SARS-CoV-2 virus je povezano sa nižim mortalitetom od COVID-19 oboljenja. Međutim, većina zemalja nema mogućnosti za takvo masivno testiranje putem metode “PCR u realnom vremenu”, zbog visoke cene neophodne opreme i potrebe za stručnim osobljem. Zbog toga se razvijaju brze i ekonomičnije metode, koje se najčešće zasnivaju na izotermalnim metodama amplifikacije DNK. Za ove metode nije potreban ciklični termostat, zbog čega su primenljivije za terensku upotrebu. Fokus je na izotermalnoj amplifikaciji posredovanoj petljom (lamP), zbog njene visoke specifičnosti, mogućnosti za upotrebu neprečišćenih uzoraka i jednostavnosti merenja signala. Autori predstavljaju pregled najvažnijih radova o LAMP metodi za detekciju SARS-CoV-2 virusa objavljenih tokom 2020. godine, kao i opise nekoliko komercijalnih kompleta na bazi LAMP metode za COVID-19 testiranje. AB - Massive testing for SARS-CoV-2 virus is related to lower mortality rates of COVID-19. Most countries face challenges to perform massive testing with the currently available methods (real-time PCR), due to expensive equipment and requirement of highly skilled personnel. To overcome these challenges, faster and cost-effective alternative detection methods are being developed, primarily based on isothermal methods of nucleic acid amplification (isoNAAs). PCR depends on precision instruments, high cleanliness of operating conditions and cannot be easily used on-site, while isoNAAs, which do not require thermal cyclers, are more applicable for point-of-care (PoC) use. Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) is one of the isoNAA most in focus for COVID-19 tests due to its high specificity and possibility to use unpurified specimens in combination with simplified detection setup. The article gives a review of the most significant publications on use of LAMP for SARS-CoV-2 detection and of the several commercial LAMP-based COVID-19 testing kits. PB - Beograd : Institut za molekularnu genetiku i genetičko inženjerstvo T2 - Trendovi u molekularnoj Biologiji T1 - Izotermalna amplifikacija posredovana petljom (lamP) kao metoda za terensku detekciju SarS-cov- virusa T1 - loop-mediated isothermal amplification (lamP) as a point-of-care SarS-covdetection method EP - 32 SP - 21 VL - 1 UR - https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_imagine_1724 ER -
@inbook{ author = "Djisalov, Mila and Knežić, Teodora and Janjušević, Ljiljana and Popović, Željko and Kosijer, Petar and Gadjanski, Ivana", year = "2021", abstract = "Pravovremeno testiranje većeg broja ljudi na SARS-CoV-2 virus je povezano sa nižim mortalitetom od COVID-19 oboljenja. Međutim, većina zemalja nema mogućnosti za takvo masivno testiranje putem metode “PCR u realnom vremenu”, zbog visoke cene neophodne opreme i potrebe za stručnim osobljem. Zbog toga se razvijaju brze i ekonomičnije metode, koje se najčešće zasnivaju na izotermalnim metodama amplifikacije DNK. Za ove metode nije potreban ciklični termostat, zbog čega su primenljivije za terensku upotrebu. Fokus je na izotermalnoj amplifikaciji posredovanoj petljom (lamP), zbog njene visoke specifičnosti, mogućnosti za upotrebu neprečišćenih uzoraka i jednostavnosti merenja signala. Autori predstavljaju pregled najvažnijih radova o LAMP metodi za detekciju SARS-CoV-2 virusa objavljenih tokom 2020. godine, kao i opise nekoliko komercijalnih kompleta na bazi LAMP metode za COVID-19 testiranje., Massive testing for SARS-CoV-2 virus is related to lower mortality rates of COVID-19. Most countries face challenges to perform massive testing with the currently available methods (real-time PCR), due to expensive equipment and requirement of highly skilled personnel. To overcome these challenges, faster and cost-effective alternative detection methods are being developed, primarily based on isothermal methods of nucleic acid amplification (isoNAAs). PCR depends on precision instruments, high cleanliness of operating conditions and cannot be easily used on-site, while isoNAAs, which do not require thermal cyclers, are more applicable for point-of-care (PoC) use. Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) is one of the isoNAA most in focus for COVID-19 tests due to its high specificity and possibility to use unpurified specimens in combination with simplified detection setup. The article gives a review of the most significant publications on use of LAMP for SARS-CoV-2 detection and of the several commercial LAMP-based COVID-19 testing kits.", publisher = "Beograd : Institut za molekularnu genetiku i genetičko inženjerstvo", journal = "Trendovi u molekularnoj Biologiji", booktitle = "Izotermalna amplifikacija posredovana petljom (lamP) kao metoda za terensku detekciju SarS-cov- virusa, loop-mediated isothermal amplification (lamP) as a point-of-care SarS-covdetection method", pages = "32-21", volume = "1", url = "https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_imagine_1724" }
Djisalov, M., Knežić, T., Janjušević, L., Popović, Ž., Kosijer, P.,& Gadjanski, I.. (2021). Izotermalna amplifikacija posredovana petljom (lamP) kao metoda za terensku detekciju SarS-cov- virusa. in Trendovi u molekularnoj Biologiji Beograd : Institut za molekularnu genetiku i genetičko inženjerstvo., 1, 21-32. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_imagine_1724
Djisalov M, Knežić T, Janjušević L, Popović Ž, Kosijer P, Gadjanski I. Izotermalna amplifikacija posredovana petljom (lamP) kao metoda za terensku detekciju SarS-cov- virusa. in Trendovi u molekularnoj Biologiji. 2021;1:21-32. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_imagine_1724 .
Djisalov, Mila, Knežić, Teodora, Janjušević, Ljiljana, Popović, Željko, Kosijer, Petar, Gadjanski, Ivana, "Izotermalna amplifikacija posredovana petljom (lamP) kao metoda za terensku detekciju SarS-cov- virusa" in Trendovi u molekularnoj Biologiji, 1 (2021):21-32, https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_imagine_1724 .