Retke bolesti u eri genomike
Ретке болести у ери геномике
2022
Preuzimanje 🢃
Autori
Stojiljković, MajaKlaassen, Kristel
Skakić, Anita
Anđelković, Marina
Spasovski, Vesna
Ugrin, Milena
Komazec, Jovana
Parezanović, Marina
Stevanović, Nina
Pavlović, Sonja
Ostala autorstva
Živić, MiroslavPetković, Branka
Konferencijski prilog (Objavljena verzija)
Metapodaci
Prikaz svih podataka o dokumentuApstrakt
Tokom poslednjih decenija, istraživanja na polju retkih bolesti napreduju
ogromnom brzinom usled sve veće upotrebe sekvenciranja nove generacije (engl.
Next-generation sequencing, NGS). Sekvenciranje kompletnog ljuskog genoma (engl.
Whole genome sequencing, WGS) osoba koje boluju od retkih bolesti je postalo
lako dostupno. Pored pronalaženja novih varijanti i novih gena koji leže u
osnovi retkih bolesti, genomika je omogućila i otkriće gena modifikatora koji
mogu da objasne uočene nedoslednosti u korelaciji genotipa i fenotipa.
Fenilketonurija je urođena metabolička retka bolest koja je uzrokovana
varijantama u genu za fenilalanin hidroksilazu (PAH). U ovoj studiji, sproveli
smo sekvenciranje kompletnog genoma 4 osobe iz nepovezanih nesrodnih porodica
koje su imale patogene varijante u PAH genu, ali nisu razvile fenilketonuriju
uprkos tome što nisu bile lečene. Otkrili smo dve nove varijante, p.Pro1591Ala
u SHANK1 i p.Asp18Asn u SHANK2 genima, kao i prethodno opisane
SHANK...2:p.Gly46Ser, SHANK2:p.Pro1388_Phe1389insLeuPro i SHANK3:p.Pro1716Thr
varijante. Računarske predikcije su pokazale da identifikovane varijante ne
ukidaju funkciju SHANK proteina. Međutim, promene u posttranslacionim
modifikacijama SHANK proteina mogu uticati na funkcionisanje
glutamatergičnih sinapsi, regulaciju citoskeleta i doprineti održavanju
optimalne sinaptičke gustine i broja dendritskih bodlji. Naši rezultati po
prvi put povezuju porodicu SHANK gena i osobine neuroloških promena kod
osoba sa fenilketonurijom.
Током последњих деценија, истраживања на пољу ретких болести напредују
огромном брзином услед све веће употребе секвенцирања нове генерације (енгл.
Next-generation sequencing, NGS). Секвенцирање комплетног љуског генома (енгл.
Whole genome sequencing, WGS) особа које болују од ретких болести је постало
лако доступно. Поред проналажења нових варијанти и нових гена који леже у
основи ретких болести, геномика је омогућила и откриће гена модификатора који
могу да објасне уочене недоследности у корелацији генотипа и фенотипа.
Фенилкетонурија је урођена метаболичка ретка болест која је узрокована
варијантама у гену за фенилаланин хидроксилазу (PAH). У овој студији, спровели
смо секвенцирање комплетног генома 4 особе из неповезаних несродних породица
које су имале патогене варијанте у PAH гену, али нису развиле фенилкетонурију
упркос томе што нису биле лечене. Открили смо две нове варијанте, p.Pro1591Ala
у SHANK1 и p.Asp18Asn у SHANK2 генима, као и претходно описане
SHANK2:p.Gly4...6Ser, SHANK2:p.Pro1388_Phe1389insLeuPro и SHANK3:p.Pro1716Thr
варијанте. Рачунарске предикције су показале да идентификоване варијанте не
укидају функцију SHANK протеина. Међутим, промене у посттранслационим
модификацијама SHANK протеина могу утицати на функционисање
глутаматергичних синапси, регулацију цитоскелета и допринети одржавању
оптималне синаптичке густине и броја дендритских бодљи. Наши резултати по
први пут повезују породицу SHANK гена и особине неуролошких промена код
особа са фенилкетонуријом.
Izvor:
Treći kongres biologa Srbije, 2022, 287-Izdavač:
- Beograd : Srpsko biološko društvo
Finansiranje / projekti:
- Ministarstvo nauke, tehnološkog razvoja i inovacija Republike Srbije, institucionalno finansiranje - 200042 (Univerzitet u Beogradu, Institut za molekularnu genetiku i genetičko inženjerstvo) (RS-MESTD-inst-2020-200042)
Napomena:
- Knjiga sažetaka: Treći Kongres biologa Srbije, Zlatibor, Srbija 21 - 25. 9. 2022.
Institucija/grupa
Institut za molekularnu genetiku i genetičko inženjerstvoTY - CONF AU - Stojiljković, Maja AU - Klaassen, Kristel AU - Skakić, Anita AU - Anđelković, Marina AU - Spasovski, Vesna AU - Ugrin, Milena AU - Komazec, Jovana AU - Parezanović, Marina AU - Stevanović, Nina AU - Pavlović, Sonja PY - 2022 UR - https://imagine.imgge.bg.ac.rs/handle/123456789/1747 AB - Tokom poslednjih decenija, istraživanja na polju retkih bolesti napreduju ogromnom brzinom usled sve veće upotrebe sekvenciranja nove generacije (engl. Next-generation sequencing, NGS). Sekvenciranje kompletnog ljuskog genoma (engl. Whole genome sequencing, WGS) osoba koje boluju od retkih bolesti je postalo lako dostupno. Pored pronalaženja novih varijanti i novih gena koji leže u osnovi retkih bolesti, genomika je omogućila i otkriće gena modifikatora koji mogu da objasne uočene nedoslednosti u korelaciji genotipa i fenotipa. Fenilketonurija je urođena metabolička retka bolest koja je uzrokovana varijantama u genu za fenilalanin hidroksilazu (PAH). U ovoj studiji, sproveli smo sekvenciranje kompletnog genoma 4 osobe iz nepovezanih nesrodnih porodica koje su imale patogene varijante u PAH genu, ali nisu razvile fenilketonuriju uprkos tome što nisu bile lečene. Otkrili smo dve nove varijante, p.Pro1591Ala u SHANK1 i p.Asp18Asn u SHANK2 genima, kao i prethodno opisane SHANK2:p.Gly46Ser, SHANK2:p.Pro1388_Phe1389insLeuPro i SHANK3:p.Pro1716Thr varijante. Računarske predikcije su pokazale da identifikovane varijante ne ukidaju funkciju SHANK proteina. Međutim, promene u posttranslacionim modifikacijama SHANK proteina mogu uticati na funkcionisanje glutamatergičnih sinapsi, regulaciju citoskeleta i doprineti održavanju optimalne sinaptičke gustine i broja dendritskih bodlji. Naši rezultati po prvi put povezuju porodicu SHANK gena i osobine neuroloških promena kod osoba sa fenilketonurijom. AB - Током последњих деценија, истраживања на пољу ретких болести напредују огромном брзином услед све веће употребе секвенцирања нове генерације (енгл. Next-generation sequencing, NGS). Секвенцирање комплетног љуског генома (енгл. Whole genome sequencing, WGS) особа које болују од ретких болести је постало лако доступно. Поред проналажења нових варијанти и нових гена који леже у основи ретких болести, геномика је омогућила и откриће гена модификатора који могу да објасне уочене недоследности у корелацији генотипа и фенотипа. Фенилкетонурија је урођена метаболичка ретка болест која је узрокована варијантама у гену за фенилаланин хидроксилазу (PAH). У овој студији, спровели смо секвенцирање комплетног генома 4 особе из неповезаних несродних породица које су имале патогене варијанте у PAH гену, али нису развиле фенилкетонурију упркос томе што нису биле лечене. Открили смо две нове варијанте, p.Pro1591Ala у SHANK1 и p.Asp18Asn у SHANK2 генима, као и претходно описане SHANK2:p.Gly46Ser, SHANK2:p.Pro1388_Phe1389insLeuPro и SHANK3:p.Pro1716Thr варијанте. Рачунарске предикције су показале да идентификоване варијанте не укидају функцију SHANK протеина. Међутим, промене у посттранслационим модификацијама SHANK протеина могу утицати на функционисање глутаматергичних синапси, регулацију цитоскелета и допринети одржавању оптималне синаптичке густине и броја дендритских бодљи. Наши резултати по први пут повезују породицу SHANK гена и особине неуролошких промена код особа са фенилкетонуријом. PB - Beograd : Srpsko biološko društvo C3 - Treći kongres biologa Srbije T1 - Retke bolesti u eri genomike T1 - Ретке болести у ери геномике SP - 287 UR - https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_imagine_1747 ER -
@conference{ author = "Stojiljković, Maja and Klaassen, Kristel and Skakić, Anita and Anđelković, Marina and Spasovski, Vesna and Ugrin, Milena and Komazec, Jovana and Parezanović, Marina and Stevanović, Nina and Pavlović, Sonja", year = "2022", abstract = "Tokom poslednjih decenija, istraživanja na polju retkih bolesti napreduju ogromnom brzinom usled sve veće upotrebe sekvenciranja nove generacije (engl. Next-generation sequencing, NGS). Sekvenciranje kompletnog ljuskog genoma (engl. Whole genome sequencing, WGS) osoba koje boluju od retkih bolesti je postalo lako dostupno. Pored pronalaženja novih varijanti i novih gena koji leže u osnovi retkih bolesti, genomika je omogućila i otkriće gena modifikatora koji mogu da objasne uočene nedoslednosti u korelaciji genotipa i fenotipa. Fenilketonurija je urođena metabolička retka bolest koja je uzrokovana varijantama u genu za fenilalanin hidroksilazu (PAH). U ovoj studiji, sproveli smo sekvenciranje kompletnog genoma 4 osobe iz nepovezanih nesrodnih porodica koje su imale patogene varijante u PAH genu, ali nisu razvile fenilketonuriju uprkos tome što nisu bile lečene. Otkrili smo dve nove varijante, p.Pro1591Ala u SHANK1 i p.Asp18Asn u SHANK2 genima, kao i prethodno opisane SHANK2:p.Gly46Ser, SHANK2:p.Pro1388_Phe1389insLeuPro i SHANK3:p.Pro1716Thr varijante. Računarske predikcije su pokazale da identifikovane varijante ne ukidaju funkciju SHANK proteina. Međutim, promene u posttranslacionim modifikacijama SHANK proteina mogu uticati na funkcionisanje glutamatergičnih sinapsi, regulaciju citoskeleta i doprineti održavanju optimalne sinaptičke gustine i broja dendritskih bodlji. Naši rezultati po prvi put povezuju porodicu SHANK gena i osobine neuroloških promena kod osoba sa fenilketonurijom., Током последњих деценија, истраживања на пољу ретких болести напредују огромном брзином услед све веће употребе секвенцирања нове генерације (енгл. Next-generation sequencing, NGS). Секвенцирање комплетног љуског генома (енгл. Whole genome sequencing, WGS) особа које болују од ретких болести је постало лако доступно. Поред проналажења нових варијанти и нових гена који леже у основи ретких болести, геномика је омогућила и откриће гена модификатора који могу да објасне уочене недоследности у корелацији генотипа и фенотипа. Фенилкетонурија је урођена метаболичка ретка болест која је узрокована варијантама у гену за фенилаланин хидроксилазу (PAH). У овој студији, спровели смо секвенцирање комплетног генома 4 особе из неповезаних несродних породица које су имале патогене варијанте у PAH гену, али нису развиле фенилкетонурију упркос томе што нису биле лечене. Открили смо две нове варијанте, p.Pro1591Ala у SHANK1 и p.Asp18Asn у SHANK2 генима, као и претходно описане SHANK2:p.Gly46Ser, SHANK2:p.Pro1388_Phe1389insLeuPro и SHANK3:p.Pro1716Thr варијанте. Рачунарске предикције су показале да идентификоване варијанте не укидају функцију SHANK протеина. Међутим, промене у посттранслационим модификацијама SHANK протеина могу утицати на функционисање глутаматергичних синапси, регулацију цитоскелета и допринети одржавању оптималне синаптичке густине и броја дендритских бодљи. Наши резултати по први пут повезују породицу SHANK гена и особине неуролошких промена код особа са фенилкетонуријом.", publisher = "Beograd : Srpsko biološko društvo", journal = "Treći kongres biologa Srbije", title = "Retke bolesti u eri genomike, Ретке болести у ери геномике", pages = "287", url = "https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_imagine_1747" }
Stojiljković, M., Klaassen, K., Skakić, A., Anđelković, M., Spasovski, V., Ugrin, M., Komazec, J., Parezanović, M., Stevanović, N.,& Pavlović, S.. (2022). Retke bolesti u eri genomike. in Treći kongres biologa Srbije Beograd : Srpsko biološko društvo., 287. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_imagine_1747
Stojiljković M, Klaassen K, Skakić A, Anđelković M, Spasovski V, Ugrin M, Komazec J, Parezanović M, Stevanović N, Pavlović S. Retke bolesti u eri genomike. in Treći kongres biologa Srbije. 2022;:287. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_imagine_1747 .
Stojiljković, Maja, Klaassen, Kristel, Skakić, Anita, Anđelković, Marina, Spasovski, Vesna, Ugrin, Milena, Komazec, Jovana, Parezanović, Marina, Stevanović, Nina, Pavlović, Sonja, "Retke bolesti u eri genomike" in Treći kongres biologa Srbije (2022):287, https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_imagine_1747 .