Bioinformatički alati za analizu mikroRNK
Bioinformatics tools for the analysis of microRNA
Abstract
Otkrivanje velikog sveta nekodirajućih RNK molekula i njihove regulatorne funkcije je rezultovalo
značajnim porastom broja publikacija i interesovanja istraživača za ovu oblast. Posebno su brojna
istraživanja jedne od klasa malih nekodirajućih RNK, mikroRNK (miRNK), kao biomarkera za
predikciju, dijagnozu i prognozu različitih humanih patologija. Razvoj i primena bioinformatičkih
alatki za analizu miRNK koje su slobodno dostupne na internetu su omogućile sprovođenje
funkcionalnih analiza miRNK, njihovih interakcija i asocijacija sa humanim bolestima. Primenom tzv.
in silico softvera za miRNK analizu istraživačima je omogućeno relativno jednostavno izvođenje zaključaka
i dalje preciznije usmeravanje toka istraživanja. U poglavlju će biti dat pregled nekoliko
odabranih i besplatno dostupnih bioinformatičkih alata čije korišćenje ne zahteva poznavanje programiranja,
a koje omogućavaju sprovođenje detaljnih analiza miRNK, funkcionalnih anotacija i asocijacija
sa humanim bolestima....
The discovery of a large world of non-coding RNA molecules and their regulatory functions has
resulted in a significant increase in publications and research interest in this field. There are numerous
studies of one of the classes of small non-coding RNA, microRNA (miRNA) as a biomarker for the
prediction, diagnosis and prognosis of various human pathologies. The development and application
of bioinformatics tools for miRNA analysis that are freely available on the internet have enabled
the implementation of functional analyzes of miRNAs, their interactions and associations with human
diseases. Applying the so-called in silico software for miRNA analysis allowed researchers to relatively
easily draw conclusions and precisely direct the flow of research. The chapter will provide an overview
of several selected and freely available bioinformatics tools whose use does not require knowledge
of programming, and which allow detailed analysis of miRNAs, functional annotations and ass...ociations
with human diseases.
Keywords:
miRNK / bioinformatika / in silico / softver / alat / bioinformatics / in silico / software / toolsSource:
Trendovi u molekularnoj Biologiji, 2022, 2, 255-274Publisher:
- Beograd : Institut za molekularnu genetiku i genetičko inženjerstvo
Funding / projects:
- Ministry of Science, Technological Development and Innovation of the Republic of Serbia, institutional funding - 200178 (University of Belgrade, Faculty of Biology) (RS-MESTD-inst-2020-200178)
Institution/Community
Institut za molekularnu genetiku i genetičko inženjerstvoTY - CHAP AU - Zeljić, Katarina PY - 2022 UR - https://imagine.imgge.bg.ac.rs/handle/123456789/1825 AB - Otkrivanje velikog sveta nekodirajućih RNK molekula i njihove regulatorne funkcije je rezultovalo značajnim porastom broja publikacija i interesovanja istraživača za ovu oblast. Posebno su brojna istraživanja jedne od klasa malih nekodirajućih RNK, mikroRNK (miRNK), kao biomarkera za predikciju, dijagnozu i prognozu različitih humanih patologija. Razvoj i primena bioinformatičkih alatki za analizu miRNK koje su slobodno dostupne na internetu su omogućile sprovođenje funkcionalnih analiza miRNK, njihovih interakcija i asocijacija sa humanim bolestima. Primenom tzv. in silico softvera za miRNK analizu istraživačima je omogućeno relativno jednostavno izvođenje zaključaka i dalje preciznije usmeravanje toka istraživanja. U poglavlju će biti dat pregled nekoliko odabranih i besplatno dostupnih bioinformatičkih alata čije korišćenje ne zahteva poznavanje programiranja, a koje omogućavaju sprovođenje detaljnih analiza miRNK, funkcionalnih anotacija i asocijacija sa humanim bolestima. AB - The discovery of a large world of non-coding RNA molecules and their regulatory functions has resulted in a significant increase in publications and research interest in this field. There are numerous studies of one of the classes of small non-coding RNA, microRNA (miRNA) as a biomarker for the prediction, diagnosis and prognosis of various human pathologies. The development and application of bioinformatics tools for miRNA analysis that are freely available on the internet have enabled the implementation of functional analyzes of miRNAs, their interactions and associations with human diseases. Applying the so-called in silico software for miRNA analysis allowed researchers to relatively easily draw conclusions and precisely direct the flow of research. The chapter will provide an overview of several selected and freely available bioinformatics tools whose use does not require knowledge of programming, and which allow detailed analysis of miRNAs, functional annotations and associations with human diseases. PB - Beograd : Institut za molekularnu genetiku i genetičko inženjerstvo T2 - Trendovi u molekularnoj Biologiji T1 - Bioinformatički alati za analizu mikroRNK T1 - Bioinformatics tools for the analysis of microRNA EP - 274 SP - 255 VL - 2 UR - https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_imagine_1825 ER -
@inbook{ author = "Zeljić, Katarina", year = "2022", abstract = "Otkrivanje velikog sveta nekodirajućih RNK molekula i njihove regulatorne funkcije je rezultovalo značajnim porastom broja publikacija i interesovanja istraživača za ovu oblast. Posebno su brojna istraživanja jedne od klasa malih nekodirajućih RNK, mikroRNK (miRNK), kao biomarkera za predikciju, dijagnozu i prognozu različitih humanih patologija. Razvoj i primena bioinformatičkih alatki za analizu miRNK koje su slobodno dostupne na internetu su omogućile sprovođenje funkcionalnih analiza miRNK, njihovih interakcija i asocijacija sa humanim bolestima. Primenom tzv. in silico softvera za miRNK analizu istraživačima je omogućeno relativno jednostavno izvođenje zaključaka i dalje preciznije usmeravanje toka istraživanja. U poglavlju će biti dat pregled nekoliko odabranih i besplatno dostupnih bioinformatičkih alata čije korišćenje ne zahteva poznavanje programiranja, a koje omogućavaju sprovođenje detaljnih analiza miRNK, funkcionalnih anotacija i asocijacija sa humanim bolestima., The discovery of a large world of non-coding RNA molecules and their regulatory functions has resulted in a significant increase in publications and research interest in this field. There are numerous studies of one of the classes of small non-coding RNA, microRNA (miRNA) as a biomarker for the prediction, diagnosis and prognosis of various human pathologies. The development and application of bioinformatics tools for miRNA analysis that are freely available on the internet have enabled the implementation of functional analyzes of miRNAs, their interactions and associations with human diseases. Applying the so-called in silico software for miRNA analysis allowed researchers to relatively easily draw conclusions and precisely direct the flow of research. The chapter will provide an overview of several selected and freely available bioinformatics tools whose use does not require knowledge of programming, and which allow detailed analysis of miRNAs, functional annotations and associations with human diseases.", publisher = "Beograd : Institut za molekularnu genetiku i genetičko inženjerstvo", journal = "Trendovi u molekularnoj Biologiji", booktitle = "Bioinformatički alati za analizu mikroRNK, Bioinformatics tools for the analysis of microRNA", pages = "274-255", volume = "2", url = "https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_imagine_1825" }
Zeljić, K.. (2022). Bioinformatički alati za analizu mikroRNK. in Trendovi u molekularnoj Biologiji Beograd : Institut za molekularnu genetiku i genetičko inženjerstvo., 2, 255-274. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_imagine_1825
Zeljić K. Bioinformatički alati za analizu mikroRNK. in Trendovi u molekularnoj Biologiji. 2022;2:255-274. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_imagine_1825 .
Zeljić, Katarina, "Bioinformatički alati za analizu mikroRNK" in Trendovi u molekularnoj Biologiji, 2 (2022):255-274, https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_imagine_1825 .