Protokol za ekstrakciju DNK i poređenje tri protokola za ekstrakciju RNK iz biljaka I. walleriana L.
A rapid protocol for DNA extraction and a comparison of tree protocols for RNA extraction from Impatiens walleriana L.
Nema prikaza
Autori
Milošević, SnežanaCingel, Aleksandar
Ninković, Slavica
Nikolić, Dragana
Jevremović, Slađana
Tadić, Vojin
Subotić, Angelina
Članak u časopisu (Objavljena verzija)
Metapodaci
Prikaz svih podataka o dokumentuApstrakt
Za detekciju i identifikaciju virusa u biljnom materijalu ili potvrdu ekspresije nekog gena nakon genetičkih transformacija neophodno je imati brzu, jednostavnu i pouzdanu metodu za ekstrakciju DNK i RNK. U ovom radu smo testirali jedan protokol za izolaciju DNK i tri za ekstrakciju RNK iz biljaka Impatiens walleriana L. RNK dobijena primenom različitih metoda za ekstrakciju znatno se razlikovala po prinosu i čistoći. Kao optimalna metoda se pokazala ona koja se primenjuje za biljne vrste koje sadrže velike količine sekundarnih metabolita (polifenola i polisaharida). Nukleinske kiseline ekstrahovane primenom ovih metoda pokazale su zadovoljavajuće rezultate u PCR i RT-PCR analizama.
In order to detect and identify viruses in the plant material or to confirm the expression of a gene after genetic transformation it is necessary to have a fast, simple and reliable method for the extraction of DNA and RNA. In this study, we tested a protocol for DNA and three protocols for RNA extraction from plants of I. walleriana L. RNA obtained by different extraction methods significantly differed in its yield and purity. The optimum method proved to be the one applicable to plant species that contain large amounts of secondary metabolites (polyphenols and polysaccharides). Nucleic acid extracted by the application of these methods showed satisfactory results in PCR and RT-PCR analysis.
Ključne reči:
TRIzol / precipitacija RNK / LiCl / fenoli / DNK / CTABIzvor:
Journal of Scientific Agricultural Research, 2011, 72, 1, 15-21Izdavač:
- Savez poljoprivrednih inženjera i tehničara, Beograd
Institucija/grupa
Institut za molekularnu genetiku i genetičko inženjerstvoTY - JOUR AU - Milošević, Snežana AU - Cingel, Aleksandar AU - Ninković, Slavica AU - Nikolić, Dragana AU - Jevremović, Slađana AU - Tadić, Vojin AU - Subotić, Angelina PY - 2011 UR - https://imagine.imgge.bg.ac.rs/handle/123456789/495 AB - Za detekciju i identifikaciju virusa u biljnom materijalu ili potvrdu ekspresije nekog gena nakon genetičkih transformacija neophodno je imati brzu, jednostavnu i pouzdanu metodu za ekstrakciju DNK i RNK. U ovom radu smo testirali jedan protokol za izolaciju DNK i tri za ekstrakciju RNK iz biljaka Impatiens walleriana L. RNK dobijena primenom različitih metoda za ekstrakciju znatno se razlikovala po prinosu i čistoći. Kao optimalna metoda se pokazala ona koja se primenjuje za biljne vrste koje sadrže velike količine sekundarnih metabolita (polifenola i polisaharida). Nukleinske kiseline ekstrahovane primenom ovih metoda pokazale su zadovoljavajuće rezultate u PCR i RT-PCR analizama. AB - In order to detect and identify viruses in the plant material or to confirm the expression of a gene after genetic transformation it is necessary to have a fast, simple and reliable method for the extraction of DNA and RNA. In this study, we tested a protocol for DNA and three protocols for RNA extraction from plants of I. walleriana L. RNA obtained by different extraction methods significantly differed in its yield and purity. The optimum method proved to be the one applicable to plant species that contain large amounts of secondary metabolites (polyphenols and polysaccharides). Nucleic acid extracted by the application of these methods showed satisfactory results in PCR and RT-PCR analysis. PB - Savez poljoprivrednih inženjera i tehničara, Beograd T2 - Journal of Scientific Agricultural Research T1 - Protokol za ekstrakciju DNK i poređenje tri protokola za ekstrakciju RNK iz biljaka I. walleriana L. T1 - A rapid protocol for DNA extraction and a comparison of tree protocols for RNA extraction from Impatiens walleriana L. EP - 21 IS - 1 SP - 15 VL - 72 UR - https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_ibiss_365 ER -
@article{ author = "Milošević, Snežana and Cingel, Aleksandar and Ninković, Slavica and Nikolić, Dragana and Jevremović, Slađana and Tadić, Vojin and Subotić, Angelina", year = "2011", abstract = "Za detekciju i identifikaciju virusa u biljnom materijalu ili potvrdu ekspresije nekog gena nakon genetičkih transformacija neophodno je imati brzu, jednostavnu i pouzdanu metodu za ekstrakciju DNK i RNK. U ovom radu smo testirali jedan protokol za izolaciju DNK i tri za ekstrakciju RNK iz biljaka Impatiens walleriana L. RNK dobijena primenom različitih metoda za ekstrakciju znatno se razlikovala po prinosu i čistoći. Kao optimalna metoda se pokazala ona koja se primenjuje za biljne vrste koje sadrže velike količine sekundarnih metabolita (polifenola i polisaharida). Nukleinske kiseline ekstrahovane primenom ovih metoda pokazale su zadovoljavajuće rezultate u PCR i RT-PCR analizama., In order to detect and identify viruses in the plant material or to confirm the expression of a gene after genetic transformation it is necessary to have a fast, simple and reliable method for the extraction of DNA and RNA. In this study, we tested a protocol for DNA and three protocols for RNA extraction from plants of I. walleriana L. RNA obtained by different extraction methods significantly differed in its yield and purity. The optimum method proved to be the one applicable to plant species that contain large amounts of secondary metabolites (polyphenols and polysaccharides). Nucleic acid extracted by the application of these methods showed satisfactory results in PCR and RT-PCR analysis.", publisher = "Savez poljoprivrednih inženjera i tehničara, Beograd", journal = "Journal of Scientific Agricultural Research", title = "Protokol za ekstrakciju DNK i poređenje tri protokola za ekstrakciju RNK iz biljaka I. walleriana L., A rapid protocol for DNA extraction and a comparison of tree protocols for RNA extraction from Impatiens walleriana L.", pages = "21-15", number = "1", volume = "72", url = "https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_ibiss_365" }
Milošević, S., Cingel, A., Ninković, S., Nikolić, D., Jevremović, S., Tadić, V.,& Subotić, A.. (2011). Protokol za ekstrakciju DNK i poređenje tri protokola za ekstrakciju RNK iz biljaka I. walleriana L.. in Journal of Scientific Agricultural Research Savez poljoprivrednih inženjera i tehničara, Beograd., 72(1), 15-21. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_ibiss_365
Milošević S, Cingel A, Ninković S, Nikolić D, Jevremović S, Tadić V, Subotić A. Protokol za ekstrakciju DNK i poređenje tri protokola za ekstrakciju RNK iz biljaka I. walleriana L.. in Journal of Scientific Agricultural Research. 2011;72(1):15-21. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_ibiss_365 .
Milošević, Snežana, Cingel, Aleksandar, Ninković, Slavica, Nikolić, Dragana, Jevremović, Slađana, Tadić, Vojin, Subotić, Angelina, "Protokol za ekstrakciju DNK i poređenje tri protokola za ekstrakciju RNK iz biljaka I. walleriana L." in Journal of Scientific Agricultural Research, 72, no. 1 (2011):15-21, https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_ibiss_365 .